Kế hoạch hành động được xây dựng nhằm cụ thể hóa các nhiệm vụ của Đề án thành những hoạt động cần thiết, xác định rõ tiến độ thực hiện và trách nhiệm của các cơ quan, đơn vị liên quan. Qua đó, kế hoạch cũng nâng cao hiệu quả quản lý, điều hành và tạo sự gắn kết chặt chẽ giữa các đơn vị thuộc Bộ, các địa phương, đối tác quốc tế và các cơ quan, tổ chức liên quan trong việc triển khai thực hiện Đề án sản xuất giảm phát thải.

Để triển khai đồng bộ và hiệu quả, các cơ quan, đơn vị thuộc Bộ và Ủy ban nhân dân các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương được yêu cầu xây dựng kế hoạch triển khai cụ thể, trên cơ sở định hướng và giải pháp của Đề án. Việc này nhằm đảm bảo các mục tiêu, nhiệm vụ và giải pháp đã đề ra được thực hiện một cách toàn diện và hiệu quả. Kế hoạch cũng cung cấp các mô hình canh tác giảm phát thải tham khảo, làm cơ sở để lựa chọn và nhân rộng các mô hình tốt, phát triển tín chỉ các-bon đáp ứng yêu cầu của các tổ chức quốc tế.

Kinh phí thực hiện Kế hoạch được bố trí từ nhiều nguồn, bao gồm: ngân sách nhà nước, chi thường xuyên, chi đầu tư phát triển, nguồn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA), các nguồn hỗ trợ kỹ thuật quốc tế và các nguồn khác thuộc quản lý của Bộ. Các cơ quan, đơn vị được giao nhiệm vụ cũng chủ động bố trí kinh phí từ các nguồn hợp tác công - tư, xã hội hóa và hợp tác phát triển khác. Các địa phương cần chủ động lồng ghép các nguồn vốn từ các chương trình, dự án phù hợp để triển khai các nội dung của Đề án. Bên cạnh đó, việc tận dụng sự hỗ trợ của các tổ chức quốc tế như Ngân hàng Thế giới, Ngân hàng Phát triển châu Á, Quỹ Tiền tệ quốc tế và các tổ chức phi chính phủ quốc tế khác là yếu tố quan trọng trong triển khai Kế hoạch.

Trong tổ chức thực hiện, các cơ quan, đơn vị thuộc Bộ và Sở Nông nghiệp và Môi trường các địa phương căn cứ các nhiệm vụ và giải pháp được phân công để triển khai. Nội dung, nhiệm vụ của Đề án và Kế hoạch được lồng ghép với các chương trình, dự án đang triển khai nhằm thực hiện ngay. Đối với các nhiệm vụ mới, các đơn vị cần xây dựng dự án, dự toán kinh phí trình cấp có thẩm quyền phê duyệt trước khi triển khai. Hằng năm, trước ngày 15/12, các đơn vị và địa phương báo cáo tiến độ, kết quả đạt được, những khó khăn, vướng mắc và kiến nghị giải pháp về Bộ Nông nghiệp và Môi trường để tổng hợp, báo cáo Bộ trưởng.

Cục Trồng trọt và Bảo vệ thực vật là cơ quan đầu mối chủ trì triển khai Kế hoạch, rà soát và hoàn thiện hệ thống chính sách về phát triển trồng trọt giảm phát thải, tổ chức thực hiện các chương trình, dự án ưu tiên, đồng thời kiểm tra, sơ kết, đánh giá kết quả thực hiện sau mỗi 5 năm. Vụ Hợp tác quốc tế chịu trách nhiệm phối hợp đẩy mạnh các hoạt động hợp tác quốc tế, thu hút đầu tư, hỗ trợ tài chính và kỹ thuật, nâng cao năng lực thực hiện các nhiệm vụ của Kế hoạch. Vụ Kế hoạch - Tài chính căn cứ đề xuất, nhiệm vụ của các đơn vị để ưu tiên bố trí nguồn kinh phí triển khai các nhiệm vụ liên quan. Vụ Khoa học và Công nghệ lồng ghép nội dung sản xuất giảm phát thải vào các chương trình nghiên cứu khoa học, thẩm định các công nghệ, thiết bị, giải pháp kỹ thuật phục vụ Đề án. Cục Biến đổi khí hậu phối hợp theo dõi, giám sát kết quả giảm phát thải khí nhà kính, tích hợp dữ liệu vào cơ sở dữ liệu ngành, hướng dẫn xây dựng hồ sơ các chương trình, dự án tạo tín chỉ các-bon phù hợp với tiêu chuẩn quốc tế.

Báo Nông nghiệp và Môi trường chủ trì thực hiện các hoạt động tuyên truyền, phổ biến thông tin về Đề án trên các phương tiện thông tin đại chúng. Trung tâm Khuyến nông quốc gia tổ chức tập huấn kỹ thuật, hướng dẫn canh tác giảm phát thải và xây dựng mô hình thực nghiệm. Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam rà soát, đánh giá hiện trạng phát thải khí nhà kính, xây dựng gói kỹ thuật canh tác giảm phát thải, đề xuất các giải pháp sản xuất phù hợp và xây dựng quy trình MRV. Các đơn vị khác thuộc Bộ, như Cục Quản lý và Xây dựng công trình thủy lợi và Cục Kinh tế hợp tác và phát triển nông thôn, triển khai các hoạt động, xây dựng chính sách và nâng cấp hạ tầng phù hợp để hỗ trợ thực hiện các mục tiêu, giải pháp của Đề án.

Trên địa bàn các tỉnh, UBND giao Sở Nông nghiệp và Môi trường làm đầu mối điều hành, tổ chức thực hiện Đề án, phân cấp trách nhiệm cho các ngành, các cấp phù hợp với điều kiện thực tế. Các địa phương rà soát, ban hành cơ chế huy động nguồn lực và vốn ngoài ngân sách, lồng ghép các chương trình, dự án khác có cùng nội dung, ưu tiên bố trí vốn đầu tư do tỉnh quản lý và huy động các nguồn lực hợp pháp nhằm hoàn thành mục tiêu Đề án. Các địa phương cũng chỉ đạo thực hiện, theo dõi, kiểm tra tiến độ, tổ chức tuyên truyền, nâng cao nhận thức cán bộ, nông dân, hợp tác xã, doanh nghiệp về lợi ích của sản xuất phát thải thấp, đồng thời thực hiện chế độ báo cáo, đánh giá theo hướng dẫn của Bộ.

Các hiệp hội, doanh nghiệp, hợp tác xã và đối tác quốc tế chủ động phối hợp với Bộ và các địa phương triển khai thực hiện hiệu quả các nội dung của Đề án và Kế hoạch hành động. Kế hoạch hành động này được coi là cơ sở quan trọng để triển khai đồng bộ, nâng cao hiệu quả quản lý ngành nông nghiệp, giảm phát thải khí nhà kính và hướng tới phát triển bền vững trong lĩnh vực trồng trọt theo tầm nhìn đến năm 2050.