Theo Dự thảo Nghị định đang được Bộ Khoa học và Công nghệ lấy ý kiến xây dựng, Ủy ban nhân dân cấp tỉnh nơi doanh nghiệp đặt trụ sở chính là cơ quan có thẩm quyền tiếp nhận hồ sơ, thẩm định và cấp Giấy chứng nhận doanh nghiệp khoa học và công nghệ, cấp thay đổi nội dung, cấp lại, thu hồi, hủy bỏ hiệu lực Giấy chứng nhận doanh nghiệp khoa học và công nghệ.

Theo đó, để được công nhận là doanh nghiệp khoa học và công nghệ, doanh nghiệp phải đảm bảo đáp ứng các điều kiện như: Tạo ra sản phẩm khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo từ một trong các kết quả nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ và đổi mới sáng tạo được sở hữu hoặc sử dụng hợp pháp.

Xét theo điều kiện về quy mô doanh nghiệp, doanh nghiệp lớn được xác định là doanh nghiệp khoa học và công nghệ phải đảm bảo: Tổng chi cho hoạt động khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo trên tổng doanh thu trung bình 3 năm gần nhất đạt tối thiểu 2%; Có bộ phận nghiên cứu và phát triển với tối thiểu 10 nhân lực có trình độ từ đại học trở lên, trong đó có ít nhất 5 nhân lực là người Việt Nam; Sản phẩm khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo chiếm tối thiểu 30% tổng doanh thu năm gần nhất.

Tương tự, với doanh nghiệp vừa và doanh nghiệp nhỏ và và siêu nhỏ, các điều kiện tương tự cũng được xây dựng nhưng với tỷ lệ ở mức độ thấp hơn.

Dự thảo Nghị định cũng đưa ra nhiều chính sách ưu đãi, hỗ trợ cho doanh nghiệp khoa học và công nghệ. Trong đó, doanh nghiệp khoa học và công nghệ được hưởng ưu đãi về thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp và ưu đãi về thời gian miễn, giảm thuế theo quy định của pháp luật về thuế thu nhập doanh nghiệp đối với thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh các sản phẩm khoa học và công nghệ. Đối với sản phẩm là dịch vụ hình thành từ chương trình máy tính phải được công nhận là dịch vụ mới để được hưởng ưu đãi về thuế suất và ưu đãi về thời gian miễn, giảm thuế.

Doanh nghiệp khi có sản phẩm mới được cấp bổ sung vào Giấy chứng nhận doanh nghiệp khoa học và công nghệ tiếp tục được hưởng mức, thời gian miễn giảm thuế thu nhập doanh nghiệp như lần đầu cấp mới, tính từ thời gian được bổ sung sản phẩm vào danh mục.

Các khoản thu nhập từ tiền lương, tiền công từ thực hiện nhiệm vụ khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo của người làm công tác nghiên cứu tại doanh nghiệp khoa học và công nghệ là các khoản thu nhập không chịu thuế thu nhập cá nhân.

Ngoài ra, doanh nghiệp khoa học và công nghệ được ưu đãi về sử dụng đất. Theo đó, dự án sản xuất, kinh doanh sản phẩm của doanh nghiệp khoa học và công nghệ được miễn tiền thuê đất theo quy định của pháp luật về đất đai, với mức áp dụng cho dự án thuộc lĩnh vực đặc biệt ưu đãi đầu tư.

Đất sử dụng để xây dựng phòng thí nghiệm, đất xây dựng cơ sở ươm tạo công nghệ và ươm tạo doanh nghiệp khoa học và công nghệ, đất xây dựng cơ sở thực nghiệm, đất xây dựng cơ sở sản xuất thử nghiệm, đất xây dựng cơ sở vật chất, hạ tầng dùng chung để hỗ trợ nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ và đổi mới sáng tạo của doanh nghiệp khoa học và công nghệ được miễn tiền thuê đất trong suốt thời gian thuê.

Doanh nghiệp khoa học và công nghệ được hưởng ưu đãi tín dụng để thực hiện các hoạt động nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ, đổi mới công 50 nghệ và sản xuất kinh doanh.