Thu thuế giá trị gia tăng tự động với hàng nhập khẩu giá trị thấp qua chuyển phát nhanh
Từ ngày 1/8/2025, cơ quan Hải quan sẽ chính thức áp dụng quy trình tự động hóa thu thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với hàng nhập khẩu giá trị thấp (dưới 1 triệu đồng) qua dịch vụ chuyển phát nhanh. Quy định mới được triển khai theo Thông tư số 29/2025/TT-BTC, nhằm đảm bảo minh bạch, chống thất thu ngân sách và hỗ trợ thương mại điện tử phát triển lành mạnh.

Bỏ miễn thuế GTGT với hàng nhập khẩu giá trị thấp
Theo Cục Hải quan, trước đó, Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư số 29/2025/TT-BTC sửa đổi, bổ sung một số điều của Thông tư số 191/TT-BTC quy định thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất nhập khẩu, quá cảnh gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh quốc tế.
Thông tư số 29/2025/TT-BTC kế thừa và cập nhật các nội dung của Thông tư số 56/2019/TT-BTC, đồng thời gắn với yêu cầu triển khai phân công hồ sơ hải quan tự động.
Ngày 8/7/2025, Cục Hải quan đã có Công văn số 13103/CHQ-GSQL thông báo kế hoạch và tài liệu hướng dẫn các Chi cục Hải quan khu vực I, II, V, VI triển khai hệ thống.
Theo đó, từ ngày 9/7-31/7/2025, Cục Hải quan áp dụng triển khai thí điểm đối với một số doanh nghiệp và từ ngày 1/8/2025, áp dụng thực hiện thủ tục hải quan đối với hàng hoá xuất nhập khẩu nhóm 2 gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh trên hệ thống đối với tất cả các doanh nghiệp chuyển phát nhanh (bao gồm đường hàng không, đường bộ, đường sắt).
Cũng theo Cục Hải quan, trước đó, thực hiện Nghị quyết số 174/2024/QH15 Kỳ họp thứ 8, Quốc hội khóa XV: “... chấm dứt ngay hiệu lực của quy định miễn thuế GTGT trong Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ, làm cơ sở cho cơ quan quản lý thuế có căn cứ pháp lý và chế tài quản lý thu đối với các sàn thương mại điện tử nước ngoài bán hàng hóa vào Việt Nam”.
Ngày 3/1/2025, Thủ tướng Chính phủ đã ban hành Quyết định số 01/2025/QĐ-TTg bãi bỏ toàn bộ Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg ngày 30/11/2010 về mức giá trị hàng hóa nhập khẩu gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh được miễn thuế.
Theo đó, từ ngày Quyết định số 01/2025/QĐ-TTg có hiệu lực thi hành (ngày 18/2/2025) sẽ không áp dụng chính sách miễn thuế GTGT đối với hàng hóa có giá trị thấp gửi qua đường chuyển phát nhanh. Chính sách miễn thuế nhập khẩu thực hiện theo quy định tại Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu và các văn bản hướng dẫn thi hành Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu nghĩa là hàng hóa nhập khẩu trị giá thấp gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh được miễn thuế nhập khẩu theo quy định tại khoản 2 Điều 29 Nghị định số 134/2016/NĐ-CP được sửa đổi, bổ sung tại khoản 11 Điều 1 Nghị định số 18/2021/NĐ-CP ngày 11/3/2021.
Thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất nhập khẩu gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh quốc tế thực hiện theo quy định tại Thông tư số 191/2015/TT-BTC đã được sửa đổi, bổ sung tại Thông tư số 56/2019/TT-BTC của Bộ trưởng Bộ Tài chính.
Theo quy định tại Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg ngày 30/11/2010 về mức giá trị hàng hóa nhập khẩu gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh miễn thuế quy định: “Điều 1. Hàng hóa nhập khẩu gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh có giá trị từ 1.000.000 đồng (một triệu đồng) trở xuống được miễn thuế nhập khẩu và thuế GTGT”.
Vì vậy, tại thời điểm ban hành Thông tư số 191/2015/TT-BTC và Thông tư số 56/2019/TT-BTC thì hàng hóa trị giá thấp được miễn thuế nhập khẩu và thuế GTGT nên người khai hải quan thực hiện khai trên tờ khai hàng hóa trị giá thấp và các chỉ tiêu thông tin của tờ khai không có chỉ tiêu thông tin liên quan đến việc tính thuế; thủ tục hải quan không có các quy định liên quan đến việc thu thuế của cơ quan Hải quan; hệ thống không có các chức năng liên quan đến việc tính và thu thuế của cơ quan Hải quan.
Hoàn thiện cơ sở pháp lý
Để triển khai thực hiện thu thuế GTGT, Bộ Tài chính đã thực hiện sửa đổi các quy định tại Thông tư số 191/2015/TT-BTC được sửa đổi, bổ sung một số điều tại Thông tư số 56/2019/TT-BTC của Bộ trưởng Bộ Tài chính.
Thực hiện Quyết định số 01/2025/QĐ-TTg có hiệu lực ngày 18/2/2025, Cục Hải quan đã hướng dẫn thực hiện thu thuế GTGT thủ công. Tuy nhiên, việc thực hiện thu thuế thủ công gây tốn nguồn lực cho cơ quan Hải quan và doanh nghiệp trong công tác thực hiện thu thuế. Vì vậy, việc ban hành cơ sở pháp lý để đảm bảo việc thu thuế tự động là cần thiết.
Nhằm đảm bảo cơ sở pháp lý ban hành kịp thời Thông tư sửa đổi bổ sung Thông tư số 191/2015/TT-BTC được thực hiện theo thủ tục rút gọn, ngày 26/5/2025, Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư số 29/2025/TT-BTC sửa đổi, bổ sung một số điều của Thông tư số 191/2015/TT-BTC (đã được sửa đổi, bổ sung tại Thông tư số 56/2019/TT-BTC), nhằm hoàn thiện quy định về thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất nhập khẩu, quá cảnh gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh quốc tế. Thông tư có hiệu lực từ ngày 9/7/2025.
Cục Hải quan nhấn mạnh, Thông tư số 29/2025/TT-BTC được ban hành là công cụ pháp lý quan trọng nhằm đảm bảo thực hiện hiệu quả các quy định thu thuế mới, phòng ngừa gian lận, thất thu ngân sách và thúc đẩy chuyển đổi số trong công tác quản lý hải quan.
Việc ban hành Thông tư số 29/2025/TT-BTC thể hiện rõ quyết tâm của Bộ Tài chính trong việc thúc đẩy cải cách hành chính, hiện đại hóa hải quan và chuyển đổi số ngành Tài chính, đồng thời hỗ trợ phát triển thương mại điện tử một cách lành mạnh, minh bạch và hiệu quả.
Thông tư cũng giúp hài hòa lợi ích quản lý nhà nước với tạo thuận lợi thương mại, vừa đảm bảo nguồn thu ngân sách từ thuế GTGT, vừa tháo gỡ vướng mắc cho doanh nghiệp trong quá trình thực hiện thủ tục nhập khẩu hàng hóa chuyển phát nhanh – lĩnh vực đang tăng trưởng rất nhanh tại Việt Nam.
Cụ thể, kế hoạch triển khai với giai đoạn thí điểm (từ ngày 9-31/7) thực hiện áp dụng với một số doanh nghiệp. Sau đó, Cục Hải quan triển khai chính thức áp dụng cho tất cả doanh nghiệp chuyển phát nhanh qua mọi hình thức (hàng không, đường bộ, đường sắt) từ ngày 1/8.