Thực hiện Nghị định số 29/2025 của Chính phủ với hiệu lực từ ngày 1/3/2025, Bộ Tài chính đã tiến hành sắp xếp lại tổ chức bộ máy mạnh mẽ để tinh gọn đầu mối và nâng cao hiệu quả hoạt động. Theo đó, số đầu mối giảm khoảng 3.600 đơn vị, tương đương giảm 37,7 phần trăm so với trước khi hợp nhất cùng các bộ, ngành liên quan.