Theo Thông tư, mức phí tham quan Bảo tàng Lịch sử Quân sự Việt Nam được quy định là 40.000 đồng cho mỗi lượt khách. Tuy nhiên, quy định cũng xác định rõ các trường hợp được miễn phí hoàn toàn. Đó là trẻ em theo quy định của pháp luật về trẻ em; người cao tuổi từ 80 tuổi trở lên; người khuyết tật đặc biệt nặng; các đối tượng thụ hưởng chính sách ưu đãi về văn hóa như người già neo đơn, người tàn tật, học sinh tại các trường phổ thông dân tộc nội trú hoặc người đang được chăm sóc tại các cơ sở bảo trợ xã hội.

Ngoài ra, những người có công với cách mạng, cựu chiến binh, sĩ quan, quân nhân chuyên nghiệp, hạ sĩ quan, binh sĩ, công nhân và viên chức quốc phòng cũng thuộc diện được miễn phí theo phê duyệt của cơ quan có thẩm quyền.

Đối với khách đối ngoại của Đảng, Nhà nước, Chính phủ, Quốc hội khi được Bộ trưởng Bộ Quốc phòng hoặc Chủ nhiệm Tổng cục Chính trị Quân đội nhân dân Việt Nam phê duyệt, cũng sẽ không phải nộp phí khi tham quan bảo tàng.

Bên cạnh các đối tượng được miễn phí, Thông tư cũng quy định rõ những trường hợp được giảm 50% mức phí. Đó là người từ đủ 16 tuổi đến dưới 18 tuổi; sinh viên, học sinh và học viên các trường đại học, cao đẳng, trung cấp hoặc trung tâm giáo dục nghề nghiệp; người cao tuổi trong độ tuổi từ 60 đến dưới 80; người khuyết tật nặng; cùng với đó là người dân cư trú tại các xã đặc biệt khó khăn, đồng bào dân tộc thiểu số sinh sống tại xã biên giới hoặc xã an toàn khu.

Trong trường hợp một người thuộc đồng thời nhiều diện giảm phí, mức ưu đãi cũng chỉ được tính là 50% so với mức phí thông thường.

Để được áp dụng chính sách miễn, giảm phí, người tham quan cần xuất trình các loại giấy tờ hợp lệ như Căn cước công dân, Chứng minh nhân dân, giấy xác nhận cư trú, thẻ sinh viên hoặc học sinh do các cơ sở giáo dục cấp, hoặc thông tin công dân trong Cơ sở dữ liệu quốc gia về dân cư.